外用硅凝胶可对疤痕起治疗效果，其主要成分为聚硅氧烷。硅凝胶能够改善疤痕的形成特性，一开始那把疤痕给封存起来，从而防止疤痕的脱水，疤痕一旦脱水，能够给纤维母细胞发出信号，让其持续的产生胶原，过多的胶原将会让疤痕变得很厚，凸出，变得很难看，如果让疤痕保持水润状态，就能够有效的减少胶原蛋白的产生。和其他封闭疤痕的方法相比，硅凝胶透气性比较好，皮肤表面的氧气容易通过，从而促使疤痕愈合。另外硅凝胶还可以把伤口边缘的拉力转嫁到自身，从而减少疤痕拉扯的张力，减少疤痕的宽度。硅凝胶还能够组织新的小血管在疤痕周边形成，让疤痕变得不那么红。最后，归凝胶形成的辅静电场能整齐地排列胶原纤维，让疤痕向内收紧。
  在医疗上有机硅凝胶可以用来作为植人体内的器官如人工乳房等，以及用来修补已损坏的器官等。